《杭州植物园》的前身是《杭州植物园通讯》，从2011年开始改刊为《杭州植物园》，是杭州植物园与杭州市风景园林学会合办的内部刊物。该刊是向国内外各界展示杭州植物园和杭州市风景园林建设、科研进展和成果的窗口，在发展过程中几经更名。
    早在1972年，杭州植物园开始用油印的《科技动态》反映杭州植物园建设的进展及其科学内容，介绍国内外有关园林科技资料。随着建园工作和科学研究的深入，1975年更名为《科技资料》。为加强国内外交流的需要，1981年更名为《杭州植物园通讯》，初定为季刊，后由于各方面原因变为不定刊，内容涉及建园及规划设计、植物引种驯化与栽培、植物分类、植物资源调查、地植物生态学和自然保护、植物生理生化与生物技术、植物遗传育种、植物保护、园林植物养护管理、科普教育等各个领域。到2010年，共发行101期。
为适应社会发展的需要，《杭州植物园通讯》从2011年开始更名为《杭州植物园》。为起到更好的宣传效果，采用通本彩色印刷、图文并茂。《杭州植物园》为植物、园林科技工作者提供了发表科技文章的机会，对促进科研工作的开展、科技成果的推广、活跃学术气氛和培养技术人才起了积极的推动作用。
    《杭州植物园》目前发放到国内外500余家单位。